国内外论文查重软件在算法原理上存在显著差异。国外的查重软件多采用先进的文本比对技术，如基于语义分析的算法，能够更准确地检测出文本相似度。而国内的查重软件大多使用基础的文本匹配算法，检测精度相对较低。此外，国外软件更新速度快，支持多语言检测，而国内软件在这方面还有待提升。

此外，国内外论文查重软件在使用范围和服务质量上也存在差异。国外的查重软件通常服务全球用户，支持跨语言、跨领域的文本检测，用户体验较为优秀。相比之下，国内的查重软件主要面向国内用户，对国外文献的检测能力有限，且部分软件服务质量不稳定。因此，选择合适的论文查重软件时，需根据实际需求和预算权衡各方面因素。