万方查重是国内常用的学术查重工具，主要用于检测中文文献的重复率。其特点是覆盖范围广，包含了大量国内外期刊和学位论文库。而知网查重则更注重国内期刊的查重，对中文文献的重复率检测更为准确，适合国内学术研究人员使用。两者在查重算法和准确度上也存在一定差异，用户可根据需求选择合适的查重工具。

此外，万方查重和知网查重在用户界面和操作体验上也有一些区别。万方查重操作简单，界面清晰易懂，适合初次使用查重工具的用户。而知网查重则更注重用户数据安全和隐私保护，操作相对复杂，但数据更为安全可靠。用户在选择查重工具时，除了考虑功能和准确度外，也应根据自身习惯和需求综合考量，选择适合自己的学术查重工具。